В феврале 1996 года в отношении губернатора Вологодской области Николая Подгорнова было возбуждено уголовное дело о взяточничестве. Как раз когда Ельцен проигрывал в этой области..... В мае того же года он был отстранен от должности. В ходе расследования Подгорнову также были предъявлены обвинения в хищениях, злоупотреблении служебным положением, присвоении авторских прав и другие - всего более 20 эпизодов по шести статьям Уголовного кодекса РФ. 2 декабря 1998 года Вологодский областной суд признал экс-губернатора виновным лишь в незаконном приобретении деталей к служебному автомобилю. Суд приговорил его к году лишения свободы условно, однако отменил приговор в связи с амнистией. В 1999 году Верховный суд РФ по иску прокуратуры отправил дело на новое рассмотрение. 28 октября 1999 года Подгорнов получил реальный срок заключения - 7 лет в колонии общего режима. 5 июня 2000 года он вышел на свободу по амнистии, объявленной в мае 2000 года.

6 октября 2016 года бывшему главе Республики Коми (2002-2010) Владимиру Торлопову было предъявлено обвинение в организации преступного сообщества, мошенничестве в особо крупном размере с использованием служебного положения и легализации денежных средств. Обвинение было предъявлено в рамках расследования уголовного дела об организованном преступном сообществе в Коми, по которому проходили экс-глава республики Вячеслав Гайзер и несколько чиновников региона. Торлопов признал свою вину. 10 июня 2019 года Замоскворецкий суд Москвы приговорил его к 6,5 года лишения свободы в колонии общего режима и штрафу в 500 тыс. рублей. При этом суд снял с экс-губернатора обвинения в создании организованного преступного сообщества. 12 июля 2021 года Ухтинский горсуд удовлетворил ходатайство Торлопова об условно-досрочном освобождении.

Глава Брянской области Николай Денин (возглавлял регион с 2004 года) 9 сентября 2014 года был отправлен в отставку в связи с утратой доверия президента РФ, а 7 ноября 2014 года в отношении него было возбуждено уголовное дело. Он обвинялся в незаконном выделении в 2011-2012 годах более 21,8 млн рублей из областного резерва птицефабрике "Снежка", подконтрольной семье Денина. 19 ноября 2015 года Советский районный суд Брянска приговорил бывшего губернатора к 4 годам лишения свободы в колонии общего режима и штрафу в размере 21,8 млн рублей. В конце апреля 2018 года Денин был освобожден условно-досрочно.

В октябре 2000 года губернатор Смоленской области Александр Прохоров (возглавлял регион с 1998 года) стал фигурантом уголовного дела о нецелевом расходовании средств при реконструкции Старой Смоленской дороги. Согласно обвинению, область лишилась 56 млн рублей из 274 млн рублей, выделенных на дорожные работы. В 2002 году Прохоров проиграл выборы губернатора Смоленской области, заняв второе место. 30 января 2003 года ему было предъявлено обвинение в превышении полномочий. 22 сентября 2004 года Ленинский районный суд Смоленска приговорил бывшего губернатора к 3 годам лишения свободы в колонии общего режима. Прохоров был освобожден в зале суда по амнистии, объявленной к 55-летию Победы в Великой Отечественной войне.